InnoDB: No valid checkpoint found.
В инете стандартный совет по этому поводу: остановить MySQL, удалить файлы ib_logfile*, ibdata*, запустить MySQL, который должен создать их сам... естественно такой вариант не очень хорошо подходит, так как перезаливать все базы из бэкапа не очень нравится.
Решение: удалить только ib_logfile*, после запуска пересоздаст их, но при этом данные сохранятся